Shraga Segal Department of Microbiology, Immunology and Genetics

המעבדה היא ביואינפורמטית, כלומר על העבודה היא באמצעות מחשבים. עם זאת, יש לנו שיתופי פעולה רבים עם קבוצות ניסוייות, ולפיכך יש אפשרות לתואר משולב שכולל גם ניסויים. המעבדה עוסקת בהבנת השונות בין חולים ובניסיון לשפר את היכולת של רופאים להתאים טיפול לחולה (רפואה פרטנית), בעיקר בתחום הסרטן. לשם כך אנו מפתחים ומשתמשים בכלים ביואינפורמטיים רבים ומגוונים, עם דגש על למידת מכונה (machine learning), וכלים אחרים מתחום ה-big data. בוגרי המעבדה בדרך כלל יודעים לתכנת או לומדים לתכנת במהלך התואר, אבל חשוב מזה לומדים את עקרונות מדעי המידע (data sciences): איך לטפל במידע, איך לשאול שאלות מועילות בתחום הסרטן על בסיס מידע, ואיך לבחון את התוצאות ולשפר את התהליך בהתאם לתוצאות. יש לנו ניסיון מצויין בהכשרת בוגרי מדעי החיים ומקצועות דומים, ללא רקע תכנותי: כל מי שרצה למד תכנות במהלך התואר. דוגמאות לפרויקטים בהם דרושים סטודנטים כרגע (דצמבר 2016): 1. הבנת התגובה החיסונית לסרטן על ידי ניתוח מתוחכם של פרופילי ביטוי של גנים* 2. הייחדוית בתגובה של saplax galilii לקרצינוגנים כבסיס לעמידות של המין לסרטן [בשיתוף פעולה עם קבוצה ניסויית מאונ' חיפה] 3. מהי הדרך הטובה ביותר לבחור פפטידים לחיסון נגד סרטן? [בשיתוף פעולה עם קבוצה ניסויית מאונ' בר אילן ובית חולים בלינסון] 4. מה התפקיד של lcRNAs ברגולציה של התא, והאם הם יכולים לשמש לאבחון וטיפול בסרטן? [בהנחיה משותפת עם קבוצה ניסויית מהפקולטה למדעי הטבע] 5. הטמעת כלי למידת המכונה החדישים ביותר (deep learning) בחיזוי מהלך המחלה [בהנחיה משותפת עם הפקולטה להנדסה] * Teltsh O, Porgador A, Rubin E. (2015) “Extracting tumor tissue immune status from expression profiles: correlating renal cancer prognosis with tumor-associated immunome” Oncotarget. 6(32):33191-205. doi: 10.18632/oncotarget.5052.

 Shraga Segal Department of Microbiology, Immunology and Genetics